| Plot | Mito | Lyso | Perox | ER | Golgi | PM | Cytosol | Nucleus | |||||
| Expt A |
6peptides |
20 spectra |
 |
0.965 0.950 | 0.976 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.021 0.006 | 0.034 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.015 0.010 | 0.019 |
||
| Plot | Mito | Lyso or Perox | ER | Golgi | PM | Cytosol | Nucleus | ||||||
| Expt B |
6 peptides |
12 spectra |
 |
0.996 0.980 | 1.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.004 0.000 | 0.018 |
| 2 spectra, AGGVGLVR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 1 spectrum, NFITCFK | 0.888 | 0.081 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.032 | |||
| 1 spectrum, VSYTQGQSPEPR | 0.857 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.143 | |||
| 2 spectra, LYHPAPER | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 3 spectra, LRPNHSGR | 0.604 | 0.213 | 0.000 | 0.000 | 0.148 | 0.016 | 0.018 | |||
| 3 spectra, LLPLAANGR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 |
| Plot | Lyso | Other | |||||||||||
| Expt C |
7 peptides |
60 spectra |
 |
0.000 0.000 | 0.000 |
1.000 1.000 | 1.000 |
||||||||
| Plot | Lyso | Other | |||||||||||
| Expt D |
1 peptide |
1 spectrum |
 |
0.000 NA | NA |
1.000 NA | NA |