| Plot | Mito | Lyso | Perox | ER | Golgi | PM | Cytosol | Nucleus | |||||
| Expt A |
36peptides |
327 spectra |
 |
0.976 0.975 | 0.977 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.005 0.003 | 0.007 |
0.019 0.018 | 0.021 |
||
| Plot | Mito | Lyso or Perox | ER | Golgi | PM | Cytosol | Nucleus | ||||||
| Expt B |
32 peptides |
228 spectra |
 |
0.941 0.938 | 0.944 |
0.038 0.036 | 0.040 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.020 0.019 | 0.022 |
0.000 0.000 | 0.000 |
| 4 spectra, LGVGGVVLLER | 0.903 | 0.072 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.025 | 0.000 | |||
| 1 spectrum, LDEYK | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 14 spectra, HGLVNAGYR | 0.876 | 0.083 | 0.000 | 0.023 | 0.000 | 0.018 | 0.000 | |||
| 9 spectra, MGVTYAAQVHLK | 0.875 | 0.053 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.072 | 0.000 | |||
| 5 spectra, TDDFGVR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 4 spectra, NGQVVGHVR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 2 spectra, SHESYAK | 0.665 | 0.271 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.064 | 0.000 | |||
| 11 spectra, IEGIQNMPNVR | 0.813 | 0.056 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.131 | 0.000 | |||
| 8 spectra, AVMAAGAK | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 2 spectra, SVPYQCTLK | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 3 spectra, FHHSLTDHPR | 0.584 | 0.231 | 0.000 | 0.098 | 0.000 | 0.087 | 0.000 | |||
| 16 spectra, NGDYALER | 0.976 | 0.024 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 2 spectra, AAGHLVR | 0.853 | 0.067 | 0.081 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 4 spectra, DPLHEELLGQGCVFQER | 0.644 | 0.214 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.141 | 0.000 | |||
| 6 spectra, AIDSLSIEK | 0.986 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.014 | |||
| 5 spectra, DPSGGPVSLDFVK | 0.926 | 0.017 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.055 | 0.003 | |||
| 2 spectra, DYAYSR | 0.646 | 0.206 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.148 | 0.000 | |||
| 2 spectra, VPVLEK | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 14 spectra, TIAYGYIR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 4 spectra, GAQVIENCAVTGIR | 0.976 | 0.013 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.010 | 0.000 | |||
| 3 spectra, ADFGFTVNK | 0.909 | 0.069 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.022 | 0.000 | |||
| 3 spectra, AYGIESHVLSPAETK | 0.958 | 0.042 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 20 spectra, TSVPFLGR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 6 spectra, DGTMDPAGTCTTLTR | 0.739 | 0.093 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.168 | 0.000 | |||
| 10 spectra, TAAAVFNMSYFGK | 0.748 | 0.133 | 0.000 | 0.065 | 0.000 | 0.054 | 0.000 | |||
| 10 spectra, FYLLGADAR | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | |||
| 7 spectra, SDDSPLEAGLAFTCK | 0.798 | 0.098 | 0.000 | 0.000 | 0.019 | 0.086 | 0.000 | |||
| 15 spectra, NYSVVFPHDEPLAGR | 0.779 | 0.109 | 0.000 | 0.028 | 0.000 | 0.084 | 0.000 | |||
| 21 spectra, VPLVAMHHAYVVTER | 0.813 | 0.115 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.071 | 0.000 | |||
| 10 spectra, DHDASVYLR | 0.684 | 0.171 | 0.000 | 0.097 | 0.000 | 0.049 | 0.000 | |||
| 2 spectra, LMSLGK | 0.801 | 0.102 | 0.000 | 0.000 | 0.062 | 0.000 | 0.035 | |||
| 3 spectra, DMYSYDIR | 0.917 | 0.067 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.016 | 0.000 |
| Plot | Lyso | Other | |||||||||||
| Expt C |
41 peptides |
1309 spectra |
 |
0.000 0.000 | 0.000 |
1.000 1.000 | 1.000 |
||||||||
| Plot | Lyso | Other | |||||||||||
| Expt D |
29 peptides |
132 spectra |
 |
0.000 0.000 | 0.000 |
1.000 1.000 | 1.000 |