| Plot | Mito | Lyso | Perox | ER | Golgi | PM | Cytosol | Nucleus | |||||
| Expt A |
130peptides |
487 spectra |
 |
0.170 0.169 | 0.170 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.257 0.256 | 0.257 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.269 0.269 | 0.270 |
0.304 0.303 | 0.304 |
||
| Plot | Mito | Lyso or Perox | ER | Golgi | PM | Cytosol | Nucleus | ||||||
| Expt B |
45 peptides |
83 spectra |
 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.000 0.000 | 0.000 |
0.056 0.047 | 0.063 |
0.430 0.421 | 0.438 |
0.248 0.246 | 0.250 |
0.266 0.263 | 0.268 |
| 2 spectra, ALCAEADR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.148 | 0.287 | 0.279 | 0.286 | |||
| 2 spectra, TLAAER | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.045 | 0.399 | 0.212 | 0.344 | |||
| 1 spectrum, ITALDEFATK | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.199 | 0.319 | 0.207 | 0.276 | |||
| 2 spectra, DLSSVQTLLTK | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.489 | 0.310 | 0.201 | |||
| 1 spectrum, LSDDNTIGQEEIQQR | 0.023 | 0.000 | 0.000 | 0.132 | 0.272 | 0.208 | 0.365 | |||
| 3 spectra, LLEAQSHFR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.190 | 0.263 | 0.182 | 0.365 | |||
| 2 spectra, HQALQAEIAGHEPR | 0.036 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.561 | 0.252 | 0.152 | |||
| 2 spectra, HALLEADVAAHQDR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.530 | 0.348 | 0.122 | |||
| 1 spectrum, VNSLGETAQR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.195 | 0.263 | 0.258 | 0.284 | |||
| 1 spectrum, LSLLESER | 0.034 | 0.266 | 0.000 | 0.000 | 0.360 | 0.035 | 0.305 | |||
| 1 spectrum, ELPTAFDYVEFTR | 0.137 | 0.067 | 0.000 | 0.000 | 0.450 | 0.346 | 0.000 | |||
| 2 spectra, LLVSSEDYGR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.424 | 0.000 | 0.148 | 0.428 | |||
| 2 spectra, LMVHTVATFNSIK | 0.079 | 0.379 | 0.000 | 0.000 | 0.259 | 0.203 | 0.080 | |||
| 1 spectrum, DLASVQALLR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.418 | 0.000 | 0.170 | 0.412 | |||
| 1 spectrum, EELITNWEQIR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.039 | 0.444 | 0.260 | 0.258 | |||
| 2 spectra, FQFFQR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.246 | 0.196 | 0.173 | 0.386 | |||
| 1 spectrum, GNAMVEEGHFAAEDVK | 0.019 | 0.021 | 0.000 | 0.000 | 0.605 | 0.329 | 0.027 | |||
| 2 spectra, QGQIDNQTR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.049 | 0.385 | 0.215 | 0.350 | |||
| 2 spectra, FLADFR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.217 | 0.207 | 0.217 | 0.359 | |||
| 3 spectra, LVQYLR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.208 | 0.188 | 0.187 | 0.417 | |||
| 1 spectrum, GVIDMGNSLIER | 0.016 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.627 | 0.271 | 0.085 | |||
| 1 spectrum, ADVVESWIGEK | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.296 | 0.159 | 0.311 | 0.234 | |||
| 2 spectra, DLTGVQNLR | 0.022 | 0.000 | 0.000 | 0.115 | 0.310 | 0.194 | 0.359 | |||
| 1 spectrum, HQAFEAELHANADR | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.247 | 0.246 | 0.173 | 0.331 | |||
| 6 spectra, LAQFVEHWK | 0.008 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.463 | 0.214 | 0.316 | |||
| 1 spectrum, LNHQEFK | 0.081 | 0.086 | 0.000 | 0.000 | 0.537 | 0.296 | 0.000 | |||
| 1 spectrum, LDILDQER | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.173 | 0.286 | 0.213 | 0.327 | |||
| 3 spectra, DVEDEETWIR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.394 | 0.000 | 0.141 | 0.466 | |||
| 1 spectrum, LDPAQSASR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.035 | 0.442 | 0.256 | 0.266 | |||
| 2 spectra, LGDSHDLQR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.208 | 0.276 | 0.220 | 0.296 | |||
| 2 spectra, AQLADSFHLQQFFR | 0.010 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.515 | 0.234 | 0.241 | |||
| 1 spectrum, EANQQQQFNR | 0.163 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.620 | 0.135 | 0.083 | |||
| 1 spectrum, QWELLLEK | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.243 | 0.146 | 0.213 | 0.399 | |||
| 3 spectra, LFGAAEVQR | 0.063 | 0.000 | 0.000 | 0.115 | 0.277 | 0.161 | 0.385 | |||
| 2 spectra, SSEEIESAFR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.387 | 0.000 | 0.129 | 0.483 | |||
| 1 spectrum, EELYQNLTR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.606 | 0.376 | 0.018 | |||
| 3 spectra, DVTGAEALLER | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.221 | 0.199 | 0.192 | 0.387 | |||
| 3 spectra, LDENSAFLQFNWK | 0.042 | 0.013 | 0.000 | 0.000 | 0.524 | 0.240 | 0.181 | |||
| 4 spectra, SADESGQALLAAGHYASDEVR | 0.071 | 0.038 | 0.000 | 0.000 | 0.595 | 0.271 | 0.025 | |||
| 1 spectrum, LDDSYR | 0.122 | 0.063 | 0.000 | 0.000 | 0.419 | 0.200 | 0.196 | |||
| 4 spectra, SLQQLAEER | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.062 | 0.377 | 0.260 | 0.301 | |||
| 1 spectrum, LQQLFR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.146 | 0.297 | 0.208 | 0.349 | |||
| 1 spectrum, DVDETIGWIK | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.199 | 0.221 | 0.218 | 0.363 | |||
| 1 spectrum, LGESQTLQQFSR | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.231 | 0.190 | 0.165 | 0.413 | |||
| 2 spectra, FLSDFR | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.286 | 0.089 | 0.266 | 0.358 |
| Plot | Lyso | Other | |||||||||||
| Expt C |
89 peptides |
312 spectra |
 |
0.000 0.000 | 0.000 |
1.000 1.000 | 1.000 |
||||||||
| Plot | Lyso | Other | |||||||||||
| Expt D |
23 peptides |
41 spectra |
 |
0.001 0.000 | 0.012 |
0.999 0.988 | 1.000 |